El sistema de control és el component bàsic d'un centre de mecanitzat vertical. Rep ordres de l'operador i controla el moviment de diversos components de la màquina. Els sistemes de control solen utilitzar sistemes CNC d'alta-precisió, que permeten rutes de mecanitzat complexes i un posicionament precís. Mitjançant el control precís del sistema de control, els centres de mecanitzat verticals poden aconseguir un mecanitzat d'alta-precisió, millorant significativament l'eficiència i la qualitat de la producció.
